Работодатель потерял заявление о предоставлении трудового отпуска и не выплатил отпускные. Какие дальнейшие действия?

Здравствуйте! Прошу проконсультировать по трудовому праву. Перед выходом в отпуск по беременности и родам я написала заявление о предоставлении очередного трудового отпуска. Заявление было завизировано и передано в отдел кадров.Однако приказ о предоставлении трудового отпуска мне на подпись не дали. Оказалось, что отдел кадров мое заявление не получал, поэтому приказ не выпустил. Соответственно отпускные мне не выплатили. Руководитель подтверждает, что заявление было. Скажите, будет ли считаться мой невыход на работу прогулом? Надо ли мне подавать повторное заявление и с какой даты?